میثم مظفر درباره ماجرای رفتن علیرضا زاکانی شهردار تهران به دولت و حواشی این موضوع گفت: این موضوع در حد گمانه زنی سیاسی در شبکه‌های اجتماعی است و هیچ منشأ و منبع موثقی ندارد. البته آقای رئیسی در ابتدای دولت به آقای زاکانی برای حضور در دولت پیشنهادهایی داده بودند اما آقای زاکانی برای شهرداری تهران کاندیدا و با رای اعتماد شورا انتخاب شدند. نمایندگان مردم در شورای شهر بر همین مبنا موافق تغییر در سطوح ارشد مدیریت شهر نیستند و مجموعه شهرداری و شورای شهر خود را بخشی از جبهه بزرگ خدمت‌رسانی به مردم و در کنار دولت خدمتگزار می‌دانند.