مرحله نیمه‌نهایی مسابقات جام حذفی فوتبال دو سال پیش بود که سپاهان اصفهان با هدایت امیر قلعه‌نویی با یک گل از پرسپولیس با هدایت برانکو ایوانکوویچ شکست خورد.
در نشست خبری پس از پایان این دیدار، قلعه‌نویی موضوعاتی را از جمله مهندسی مسابقات برای نتیجه گرفتن پرسپولیس مطرح کرد که با واکنش باشگاه پرسپولیس مبنی بر شکایت از این مربی فوتبال به مرجع قضایی مواجه شد.
مهدی ذاکر مدیر حقوقی وقت باشگاه پرسپولیس گفته بود: قلعه نویی موضوعاتی را از جمله مهندسی بازی‌ها برای نتیجه گرفتن پرسپولیس به این باشگاه و وزارت ورزش منتسب کرده که اگر اسناد و مدارکی دال بر صحت ادعای خود داشته باشد باید به مرجع قضایی ارائه کند و این مرجع قضایی است که با رسیدگی های خود وقوع یا عدم وقوع جرم را احراز می‌کند.
با شکایت باشگاه پرسپولیس پرونده در دست رسیدگی مرجع قضایی قرار گرفت که در دادگاه بدوی قلعه‌نویی از اتهام وارده تبرئه شد. با اعتراض پرسپولیس به حکم صادره، پرونده در دادگاه تجدیدنظر استان تهران مورد رسیدگی واقع شد که دادگاه تجدیدنظر ضمن تایید حکم دادگاه بدوی، قلعه‌نویی را تبرئه کرد.