به گزارش همشهری‌آنلاین؛ خاشقچی ۵۹ ساله، در ۲ اکتبر ۲۰۱۸ وارد کنسولگری سعودی در استانبول شد و هرگز آنجا را ترک نکرد.
او به وسیله گروهی از ماموران اعزامی کشته و بعد بدنش مثله شد. جسد او هیچ‌گاه به دست نیامد.
در گزارش دفتر اطلاعات ملی آمریکا آمده است؛ «ارزیابی ما این است که محمد بن سلمان، ولیعهد عربستان سعودی مجوز انجام عملیاتی در استانبول ترکیه برای دستگیری یا قتل روزنامه‌نگار سعودی، جمال خاشقچی را صادر کرد. ولیعهد سعودی، خاشقچی را تهدیدی مستقیم برای پادشاهی عربستان می‌دید و از اقدامات خشن برای ساکت کردن او حمایت می‌کرد.»
اما وزارت خارجه عربستان اعلام کرد که دولت عربستان گزارشی را که به کنگره درباره جنایت کشتن جمال خاشقچی ارائه شده به طور کامل رد می‌کند: آن چیزی که در گزارش ذکر شده نتیجه‌گیری‌های اهانت آمیز و غیرصحیح درباره مقام‌های ارشد کشور بوده که به هیچ وجه نمی‌توان آن را قبول کرد همچنین این گزارش شامل مجموعه‌ای از اطلاعات و نتیجه‌گیری‌های غیرصحیح است.
کاخ سفید با این حال اعلام کرده است: ما اطمینان قوی داریم که افراد زیر به نیابت از بن‌سلمان اقدام به صدور دستور قتل خاشقچی کردند و یا به طرق دیگر در قتل او همدستی کرده و یا مقصر هستند؛
- سعود القحطانی
- ماهر مطرب
- نائف العریفی
- محمد الزهرانی
- منصور اباحسین
- عبدالعزیز الهوساوی
- ولید عبدالله الشهیری
- خالد العتیبه
- فهد شبیب البلوی
- مشعل سعد البستانی
- ترکی الشهیری
- مصطفی المدنی
- احمد زاید عسیری
- عبدالله محمد الهرینی
- یاسر خالد السالم
- ابراهیم السلیم
- صلاح الطبیعی
- محمد العتیبی